Ce sujet, issu d'une collaboration entre le LIMOS et le LPC, s'inscrit dans une demarche de recherche permettant la mise en synergie des domaines de la biologie, de la physique et de l'informatique par la proposition d'une demarche de simulation permettant la realisation d'experiences in silico. Pour cela, nous nous proposons de developper une plateforme logicielle dediee a la modelisation multiechelle des systemes biologiques, qui pourra par la suite etre interfacee avec les outils de simulation de physique des particules, ainsi qu'un modele individu-centre de cellule biologique parametrable a l'aide de donnees obtenues d'experiences in vitro. Nous presentons l'elaboration de cette plateforme et la demarche de validation de ses fonctionnalites a travers l'implementation de modeles d'automates cellulaires de la litterature. Nous presentons ensuite la construction du modele de cellule en prenant le temps d'expliquer comment est pris en compte le systeme biologique, comment nous le modelisons puis comment nous parametrons le modele. Le modele est alors utilise pour retrouver les courbes de croissance d'une population de bacteries E. coli en utilisant des donnees de fluxomique."
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